เอฟเอพรีเมียร์ลีก ฤดูกาล 2006–07 เป็นฤดูกาลที่ 15 ของพรีเมียร์ลีก เริ่มแข่งขันวันที่ 19 สิงหาคม ค.ศ. 2006 และสิ้นสุดวันที่ 13 พฤษภาคม ค.ศ. 2007 โดยเชลซีเป็นแชมป์เก่าที่พยายามป้องกันแชมป์ แต่สุดท้าย แมนเชสเตอร์ยูไนเต็ด คว้าแชมป์สมัยที่ 9 ได้สำเร็จ หลังเชลซีเสมออาร์เซนอล 1–1 ในวันที่ 6 พฤษภาคม ค.ศ. 2007 ทำให้แมนยูเป็นแชมป์ครั้งแรกนับตั้งแต่ปี 2003

ระหว่างฤดูกาล ในเดือนกุมภาพันธ์ ค.ศ. 2007 ลีกได้เปลี่ยนชื่อจากเอฟเอพรีเมียร์ลีกเป็น พรีเมียร์ลีก พร้อมโลโก้และแบรนด์ใหม่ แต่ยังคงสปอนเซอร์คือบาร์คลีย์

ฤดูกาลนี้เป็นฤดูกาลที่ทำประตูรวมน้อยที่สุดในประวัติศาสตร์พรีเมียร์ลีก มีเพียง 931 ประตู เฉลี่ย 2.45 ประตูต่อนัด

ทีมที่ตกชั้นได้แก่ เชฟฟิลด์ยูไนเต็ด, ชาร์ลตันแอทเลติก และวัตฟอร์ด ขณะที่เรดิง, เชฟฟิลด์ยูไนเต็ด และวัตฟอร์ดเลื่อนชั้นขึ้นมา

นอกจากนี้ยังมีเหตุการณ์น่าสนใจ เช่น โมริทซ์ โฟลซ์ ยิงประตูที่ 15,000 ของพรีเมียร์ลีก และพอล โรบินสัน ผู้รักษาประตูทอตแนมทำประตูจากฟรีคิกระยะ 83 หลา