Japonya'nın bölgeleri, resmî idari birimler olmayıp, ülkenin geleneksel coğrafi bölgeleridir ve haritalardan hava durumu raporlarına kadar pek çok alanda kullanılmaktadır. Kuzeyden güneye doğru sıralanan bu bölgeler Hokkaidō, Tōhoku, Kantō, Chūbu, Kansai, Chūgoku, Shikoku, Kyūshū ve Ryukyu Adaları'dır. Özellikle Kantō bölgesi, başkent Tokyo'yu içermesiyle en kalabalık bölgedir (yaklaşık 42 milyon nüfus), Chūbu ise Hokuriku, Kōshin'etsu ve Tōkai gibi alt bölgelere ayrılabilmektedir. Her bölge genellikle birden fazla prefektörlük içerirken, Hokkaidō bu kuralın istisnası olarak tek bir prefektörlükten oluşur. Şirketler ve üniversiteler (örneğin Tohoku Üniversitesi) bu bölge adlarını kullanarak kimliklerini güçlendirir; bu da bölgelerin Japon toplumundaki kültürel ve pratik önemini gösterir.