Kroatia on osallistunut yleisurheilun Euroopan-mestaruuskilpailuihin omana joukkueenaan vuodesta 1994, ja sitä ennen sen urheilijat edustivat Jugoslaviaa. Yhteensä Kroatia on saavuttanut kisoissa kymmenen mitalia, joista kuusi on kultaa, sijoittuen mitalitilastossa 27. sijalle. Maan ylivoimainen tähti on kiekonheittäjä Sandra Perković, joka on voittanut peräti viisi Euroopan-mestaruutta (2010, 2012, 2014, 2016 ja 2018), ja korkeushyppääjä Blanka Vlašić voitti kultaa vuonna 2010. Muita mitalisteja ovat olleet Branko Zorko (pronssia 1500 metrillä 1994), Siniša Ergotić (hopeaa pituushypyssä 2002), Ana Šimić (pronssia korkeushypyssä 2014) ja Sara Kolak (pronssia keihäänheitossa 2016). Mielenkiintoista on myös se, että vuoden 1990 EM-kilpailut käytiin Splitissä, joka nykyään kuuluu Kroatiaan, vaikka maa ei vielä silloin kilpaillut itsenäisenä.