ฤดูกาล 2016–17 เป็นฤดูกาลที่ 115 ของสโมสรฟุตบอลแมนเชสเตอร์ซิตี และเป็นปีที่ 88 ในฟุตบอลอังกฤษ รวมถึงปีที่ 20 ในพรีเมียร์ลีก โดยสโมสรได้เปิดตัวโลโก้ใหม่ในเดือนกรกฎาคม 2016 และใช้จริงในนัดพบซันเดอร์แลนด์วันที่ 26 ธันวาคม ปรีซีซันเริ่มด้วยการพบกับบาเยิร์นมิวนิก และเข้าร่วมอินเตอร์เนชันแนลแชมเปียนส์คัพกับแมนยูและดอร์ทมุนด์ รวมถึงนัดพิเศษกับอาร์เซนอล ในพรีเมียร์ลีกทีมมีผลงานโดยรวม แต่ไม่ระบุอันดับ ในการแข่งขันฟุตบอลถ้วย เอฟเอคัพพบเวสต์แฮม ยูไนเต็ด และในยูฟ่าแชมเปียนส์ลีกผ่านรอบเพลย์ออฟชนะสเตอัวบูคาเรสต์ เข้ารอบแบ่งกลุ่มพบกับบาร์เซโลนา, โบรุสซีอาเมินเชินกลัทบัค และเซลติก สโมสรใช้เงินซื้อผู้เล่นรวม 149.57 ล้านปอนด์ในฤดูกาลนี้