Bacillus thuringiensis (forkortet Bt) er en almindelig jordbakterie, der er kendt for at producere giftstoffer, kaldet Cry-toxiner, som er skadelige for mange insektlarver. Disse toxiner nedbryder tarmen hos sommerfugle-, bille- og fluelarver, men anses for at være helt uskadelige for mennesker. Allerede i 1996 kom de første gensplejsede afgrøder med Bt-toxin på markedet, og i 2004 blev der dyrket 22,4 millioner hektar, primært majs, bomuld og kartofler, hvoraf majssorten MON 863 er særligt kendt. Selvom Bt-afgrøder anses for at være mere miljøvenlige end syntetiske pesticider og er godkendt i Europa, har der været stor modstand, særligt i Danmark, med krav om forbud mod import og dyrkning. I Kina har man dog haft succes med Bt-bomuld siden 1997, hvor et ti-årigt studie viste et markant fald i bestanden af den skadelige bomuldsmøl, hvilket også gavnede udbyttet af andre afgrøder i området.