Климат Магадана — субарктический, с чертами морского муссонного, что делает его уникальным для этой широты: город расположен на одной широте с Санкт-Петербургом, но из-за близости Охотского моря климат здесь значительно суровее. Зима длитсядолго и отличается нестабильной ветреной погодой (среднегодовая скорость ветра — 7–8 м/с, порывы могут превышать 40 м/с), а лето — короткое, прохладное и туманное: самый тёплый месяц — август с дневным максимумом +15 °C, при этом сильная жара практически исключена. Абсолютный максимум +27,8 °C был зафиксирован лишь 15 июля 2021 года, а рекордный минимум −39,6 °C — в январе 1954 года, что сопоставимо с показателями юга европейской части России. Интересно, что море играет роль гигантского аккумулятора: весной тающие льды охлаждают берег, а осенью и зимой тёплые воды смягчают морозы, делая их вдвое слабее, чем в глубине материка. При этом ветер сильно усугубляет восприятие холода — по словам метеорологов, 24 градуса мороза с ветром в Магадане переносятся тяжелее, чем 45 градусов безветрия на трассе «Колыма». Среднегодовая температура здесь составляет −2,7 °C, а нулевую отметку термометр преодолевает только в мае.