กรมทหารพรานที่ 46 เป็นหน่วยเฉพาะกิจในพื้นที่จังหวัดชายแดนภาคใต้ รับผิดชอบอำเภอรือเสาะ จังหวัดนราธิวาส มีกองบัญชาการที่พระตำหนักทักษิณราชนิเวศน์ จัดตั้งเมื่อวันที่ 1 สิงหาคม พ.ศ. 2550 โดยเริ่มแรกมี 12 กองร้อย และขยายเป็น 16 กองร้อยในปี 2551 พร้อมหน่วยสุนัขทหารสำหรับตรวจค้นวัตถุระเบิดและดมกลิ่นแกะรอย หน่วยนี้เคยปะทะกับผู้ก่อความไม่สงบหลายครั้ง เช่น ปฏิบัติการในปี 2559 นำโดย พ.อ.พสิษฐ์ ชาญเลขา ที่ยึดอาวุธปืนได้ แต่สูญเสียอาสาสมัครทหารพราน 1 นาย และในปี 2554 สิบโทศักดา พรรณา อดีตนักคาราเต้ทีมชาติไทย ถูกยิงเสียชีวิตขณะปฏิบัติหน้าที่ นอกจากนี้ยังมีกิจกรรมเพื่อสังคม เช่น มอบรถเข็นคนพิการ ถุงยังชีพช่วงน้ำท่วม และโครงการแสงแห่งความหวังมอบแว่นสายตา