La Recopa Sudamericana 2006, organizada por la CONMEBOL, fue la decimocuarta edición de este torneo que enfrenta anualmente a los campeones de la Copa Libertadores y la Copa Sudamericana. En esta ocasión, se enfrentaron el brasileño São Paulo, campeón de la Libertadores 2005, y el argentino Boca Juniors, vencedor de la Sudamericana 2005. La final se resolvió en dos partidos disputados los días 7 y 14 de septiembre de 2006 en Buenos Aires y São Paulo, donde el conjunto xeneize se impuso con un marcador global de 4-3. Este triunfo le permitió a Boca Juniors alcanzar su tercer título en la competencia, convirtiéndose en el máximo ganador histórico del torneo. Dicho récord se mantiene hasta la actualidad, ya que posteriormente el club amplió su palmarés a cuatro conquistas, consolidando su supremacía en este certamen.