La División de Honor Juvenil 2012-13 se disputó entre el 1 de septiembre de 2012 y el 21 de abril de 2013, con la participación de 112 equipos divididos en siete grupos de 16 según su proximidad geográfica. El sistema de competición fue una liga regular de 30 jornadas, donde los campeones de cada grupo, junto con el mejor subcampeón, se clasificaron para la Copa de Campeones, mientras que los cuatro últimos de cada grupo descendieron a la Liga Nacional Juvenil. La XIX edición de la Copa de Campeones se celebró en Vigo del 6 al 11 de mayo de 2013, con la participación de los siete campeones de grupo y el Atlético de Madrid Juvenil "A" como mejor subcampeón. El campeón fue el Sevilla Fútbol Club Juvenil, que revalidó su título al vencer por 3-2 al anfitrión Real Club Celta de Vigo Juvenil en la final. Con este triunfo, el Sevilla se consolidó como el segundo equipo más laureado de la competición con cuatro títulos, solo superado por los nueve del Real Madrid Club de Fútbol Juvenil.