1. Fußball-Bundesliga 2008-09 var den 46. sæson af den tyske topklasse og blev spillet fra 15. august 2008 til 23. maj 2009, med Bayern München som forsvarende mester. Sæsonen bød på en historisk triumf, da VfL Wolfsburg for første gang blev tyske mestre, to point foran Bayern München og tre point foran VfB Stuttgart, mens brasilianske Grafite fra mesterholdet blev topscorer med 28 mål. En væsentlig ændring i strukturen var indførelsen af playoff-kampe, hvor tredjesidstepladsen i Bundesligaen skulle møde tredjepladsen fra 2. Bundesliga. I denne playoff tabte Energie Cottbus klart til 1. FC Nürnberg (0-3 og 0-2), hvilket sendte Nürnberg op sammen med SC Freiburg og 1. FSV Mainz 05, mens Cottbus måtte rykke ned sammen med Karlsruhe og Bielefeld. Derudover kvalificerede Werder Bremen sig til Europa Leagues playoff-runde via deres pokalsejr, hvilket afsluttede en dramatisk sæson med både nye mestre og nye op- og nedrykningsregler.