ארמניה ואזרבייג'ן, המסוכסכות סביב אזור נגורנו קרבאך, הביאו את הסכסוך שלהן גם לבמת האירוויזיון, כשהשתיים החלו להשתתף בתחרות ב-2006 וב-2008 בהתאמה. המחלוקות הראשונות החלו ב-2006, כשאתר האירוויזיון ציין את מקום הולדתו של הזמר הארמני אנדרה כנגורנו קרבאך, ובמיוחד החריפו ב-2009, לאחר שאזרבייג'ן התנגדה להצגת הפסל "אנחנו ההרים שלנו" בגלויה, וארמניה מחתה על כך בהצגת תמונותיו במהלך שידור ההצבעה. בעקבות התחרות ב-2009, חקרה אזרבייג'ן אזרחים שהצביעו לשיר הארמני, האשימה אותם בחוסר פטריוטיות, ונקנסה על ידי איגוד השידור האירופי (EBU) בשל הפרת פרטיות הבוחרים. הסכסוך נמשך גם בשנים הבאות: ארמניה הובילה מאמץ חרם נגד אירוויזיון 2012 שהתקיים בבאקו, וחזרה רק ב-2013, וב-2015 שינתה את שם שירה "Don't Deny" ל-"Face the Shadow" לאחר שאזרבייג'ן ראתה בו קריאה להכרה ברצח העם הארמני. ב-2016 ננזפה הנציגה הארמנית איווטה מוקוצ'יאן על ידי המארגנים לאחר שהציגה את דגל נגורנו קרבאך במהלך חצי הגמר, מה שממחיש כיצד הסכסוך הטריטוריאלי ממשיך להשפיע על התחרות גם שנים לאחר מכן.