Ο Δήμος Μαραθώνος, όπως υφίσταται σήμερα, συστάθηκε το 2011 με το Πρόγραμμα Καλλικράτης, από τη συνένωση των πρώην δήμων Νέας Μάκρης και Μαραθώνος και των κοινοτήτων Γραμματικού και Βαρνάβα. Η έκτασή του ανέρχεται σε 226,55 τ.χλμ. και ο πληθυσμός του, σύμφωνα με την απογραφή του 2021, είναι 31.331 κάτοικοι, με έδρα τον Μαραθώνα. Ιστορικά, ο δήμος πρωτοσυστάθηκε το 1835 ως ένας από τους επτά δήμους της Επαρχίας Αττικής, καταργήθηκε το 1912 και αντικαταστάθηκε από μικρότερες κοινότητες. Η Κοινότητα Μαραθώνος αναγνωρίστηκε ξανά σε δήμο το 1989, ενώ με το Σχέδιο Καποδίστρια παρέμεινε αμετάβλητος, για να διευρυνθεί τελικά το 2011 με τον Καλλικράτη. Ένα αξιοσημείωτο γεγονός είναι ότι το 2014, ο δήμαρχος Ηλίας Ψινάκης κήρυξε τον δήμο σε κατάσταση πτώχευσης.