Ergenekon davaları, Fetullahçılar tarafından kurgulandığı öne sürülen ve "Ergenekon" adlı gizli bir örgütün varlığı iddiasıyla açılan davalardır. İlk dava, 25 Temmuz 2008'de 86 sanık hakkında hazırlanan iddianameyle başlamış ve duruşmalar Silivri Cezaevi'nde yapılmıştır. 27 Nisan 2012'de İstanbul 13. Ağır Ceza Mahkemesi, birinci ve ikinci Ergenekon davalarını birleştirerek toplam 16 iddianameyi tek dosyada toplamıştır. Bu kapsamda Danıştay saldırısı, Cumhuriyet gazetesine molotofkokteyli atılması, Rum Ortodoks Patriği I. Bartholomeos'a suikast hazırlığı ve Şile'deki mühimmat gibi birçok dava da ana dava ile birleştirilmiştir. İkinci Ergenekon davası ise 25 Mart 2009'da 58 sanıklı iddianameyle açılmış, daha sonra 52 sanıklı iddianame ve 30 sanıklı "İrticayla Mücadele Eylem Planı" davası da bu kapsama dahil edilmiştir. Davaların temelini, 2003-2004 yıllarında hükümeti silah zoruyla devirmeyi amaçladığı öne sürülen Sarıkız, Ayışığı, Yakamoz ve Eldiven kod adlı darbe planları oluşturmaktadır.