Το πρωτάθλημα της περιόδου 1963-64 ήταν το πέμπτο που διεξήχθη σε μορφή εθνικής κατηγορίας και ανέδειξε πρωταθλητή τον Παναθηναϊκό, ο οποίος κατέκτησε τον τίτλο για 7η φορά στην ιστορία του. Το πιο εντυπωσιακό επίτευγμα ήταν ότι οι «πράσινοι» ολοκλήρωσαν τη σεζόν αήττητοι, κάτι που συνέβη για πρώτη φορά στην Α' Εθνική, υπό την καθοδήγηση του προπονητή Στέφαν Μπόμπεκ. Ένα από τα πιο αμφιλεγόμενα γεγονότα ήταν ο αγώνας Ολυμπιακού-ΠΑΟΚ, όπου οι παίκτες του ΠΑΟΚ αποχώρησαν διαμαρτυρόμενοι για διαιτητική απόφαση του Βούλγαρου διαιτητή Ρουμέντσεφ, με αποτέλεσμα το ματς να κατοχυρωθεί 2-0 υπέρ του Ολυμπιακού. Η τιμωρία του ΠΑΟΚ περιορίστηκε στην αφαίρεση ενός βαθμού, ενώ το σύστημα βαθμολογίας ήταν ιδιαίτερο (νίκη 3, ισοπαλία 2, ήττα 1), με τον ΠΑΟΚ και το Αιγάλεω να έχουν επίσης ποινή αφαίρεσης βαθμού. Στην 14η θέση, που οδηγούσε σε αγώνα μπαράζ, βρέθηκε η Νίκη Βόλου, ενώ από την πλευρά του πρωταθλητή, ο Παναγιώτης Πανάκης ήταν ο πρώτος σκόρερ της ομάδας με 15 γκολ, με τους Δομάζο, Λουκανίδη και Παπουτσάκη να πρωταγωνιστούν.