ผลงานเพลงของซูเปอร์จูเนียร์ เริ่มต้นอย่างเป็นทางการในปี 2005 กับอัลบั้มแรก Super Junior 05 (Twins) และมีวิวัฒนาการอย่างต่อเนื่องจนถึงปี 2014
อัลบั้มสตูดิโอหลักมีทั้งหมด 7 ชุด ไล่ตั้งแต่ Don't Don (2007), Sorry, Sorry (2009), Bonamana (2010), Mr. Simple (2011), Sexy, Free & Single (2012) จนถึง Mamacita (2014)
จุดเปลี่ยนสำคัญของวงคืออัลบั้ม Sorry, Sorry ในปี 2009 ซึ่งกลายเป็นเพลงฮิตไปทั่วเอเชีย และตามมาด้วย Mr. Simple ที่ช่วยเสริมความโด่งดังในระดับสากล
นอกจากอัลบั้มหลัก วงยังปล่อยอัลบั้มพิเศษ This Is Love (2014) ซึ่งเป็นรีแพ็กเกจของ Mamacita และมีซิงเกิลร่วมกับวงทงบังชินกีในเพลง "Show Me Your Love" (2005)
วงยังมีส่วนร่วมในอัลบั้มรวมเพลงของค่าย SMTOWN ทั้งช่วงซัมเมอร์และวินเทอร์ (2006-2007) พร้อมทั้งผลงานของกลุ่มย่อยอย่าง Super Junior-K.R.Y. ในอัลบั้มเหล่านั้น
โดยรวมแล้ว ซูเปอร์จูเนียร์ได้ทิ้งมรดกทางดนตรีไว้อย่างหลากหลาย ตั้งแต่ยุคบุกเบิกเคป็อปจนถึงทศวรรษ 2010 คงความเป็นตำนานได้อย่างต่อเนื่อง