Carlos de Almeida Baptista Junior (nascido em Fortaleza, em 1960) é um tenente-brigadeiro que comandou a Força Aérea Brasileira (FAB) entre abril de 2021 e janeiro de 2023. Com uma carreira de 46 anos, ele foi piloto de caça, acumulando cerca de 4.500 horas de voo em aeronaves como Mirage III e F-5, e é filho do também ex-comandante da FAB Carlos de Almeida Baptista.

Durante seu comando, ele criticou a CPI da COVID-19 e foi acusado por aliados do presidente Bolsonaro de apoiar um golpe de Estado, o que ele negou publicamente. Em 2 de janeiro de 2023, ele passou o cargo ao tenente-brigadeiro Marcelo Kanitz Damasceno.

Em 2025, em depoimento ao STF, Baptista Junior confirmou que participou de reuniões com Jair Bolsonaro onde foi apresentada uma minuta golpista, após o segundo turno das eleições de 2022. No entanto, o relatório final da Polícia Federal indicou que a tentativa de golpe não se concretizou porque ele e outros comandantes não cederam às pressões golpistas.