הפועל ירושלים, שנוסדה ב-1926 כחלק מתנועת הפועל, היא אגודת הספורט המובילה בירושלים, ומפעילה ענפים כמו כדורסל, כדורגל, שחייה וכדוריד. בתחילת שנות ה-90 עברה האגודה הפרטה, וענפיה השונים נמכרו לעמותות נפרדות. מועדון הכדורסל, שנוסד ב-1943, הוא מהבכירים בישראל, וזכה בשתי אליפויות (2015, 2017), שישה גביעי מדינה ובגביע יול"ב היוקרתי ב-2004. מועדון הכדורגל, שזכה בגביע המדינה ב-1973, איבד את הבכורה לבית"ר, אך מאז 2020 הוא מנוהל על ידי אוהדים לאחר ש"הפועל קטמון" רכשה את הזכויות על השם, מה שהופך אותו למועדון האוהדים הבכיר בישראל. בתחום השחייה, האגודה נחשבת למובילה בארץ, ומועדון כדורסל הנשים (שזכה באליפות ב-1960) הוא שריד אחרון שעדיין שייך להסתדרות. לצד אלה פועלים גם מועדוני כדורעף, כדוריד ואתלטיקה, המבססים את מעמדה של הפועל ירושלים כמוסד ספורט מרכזי בעיר.