FK Kauno Žalgiris is een Litouwse voetbalclub uit Kaunas en vormt de voetbalafdeling van de bekende basketbalclub Žalgiris Kaunas. De club werd in 2004 opgericht als Spyris Kaunas en doorliep de lagere divisies, om in 2015 op het hoogste niveau, de A Lyga, te debuteren. In 2016 fuseerde de club met Žalgiris Kaunas en nam de huidige naam aan, maar degradeerde datzelfde jaar nog; door het terugtrekken van FK Šilas mocht de club echter alsnog op het hoogste niveau blijven. De club behaalde haar grootste succes in 2025 door voor het eerst landskampioen te worden, gevolgd door het winnen van de Supertaurė in 2026. Bekende (ex-)spelers zijn onder anderen de Fransman Steven Thicot en de Marokkaan Amine Benchaib. Met deze prestaties heeft de club zich in korte tijd ontwikkeld tot een serieuze kracht in het Litouwse voetbal.