Τα Ανώτατα Εκπαιδευτικά Ιδρύματα (Α.Ε.Ι.) στην Ελλάδα είναι δημόσια, πλήρως αυτοδιοικούμενα Νομικά Πρόσωπα Δημοσίου Δικαίου, με την ποιότητά τους να ελέγχεται από την ανεξάρτητη Εθνική Αρχή Ανώτατης Εκπαίδευσης (ΕΘΑΑΕ). Στα Α.Ε.Ι. κατοχυρώνεται η ακαδημαϊκή ελευθερία, ενώ η διάρθρωσή τους περιλαμβάνει Πανεπιστήμια, Πολυτεχνεία, την Ανωτάτη Σχολή Καλών Τεχνών και Εκκλησιαστικές Ακαδημίες, με τη φοίτηση να διαρκεί συνήθως 4 έτη, φτάνοντας τα 5 ή 6 σε τεχνικές, ιατρικές και καλλιτεχνικές σχολές. Μεταξύ των πιο γνωστών ιδρυμάτων ξεχωρίζουν το Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών, το Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης και το Εθνικό Μετσόβιο Πολυτεχνείο. Από το 2013 έως το 2019, μια μεγάλη μεταρρύθμιση οδήγησε στην κατάργηση πολλών Τεχνολογικών Εκπαιδευτικών Ιδρυμάτων (Τ.Ε.Ι.), των οποίων τα τμήματα απορροφήθηκαν από υπάρχοντα ή νεοϊδρυθέντα πανεπιστήμια. Χαρακτηριστικά παραδείγματα είναι η ίδρυση του Πανεπιστημίου Δυτικής Αττικής (2018), η ενσωμάτωση των ΤΕΙ στο Διεθνές Πανεπιστήμιο της Ελλάδος και η δημιουργία του Ελληνικού Μεσογειακού Πανεπιστημίου (2019). Αυτές οι συγχωνεύσεις αναμόρφωσαν ριζικά τον χάρτη της τριτοβάθμιας εκπαίδευσης, ενοποιώντας την τεχνολογική με την πανεπιστημιακή εκπαίδευση σε όλη τη χώρα.