मैसूर जंक्शन (स्टेशन कोड: MYS) कर्नाटक के मैसूर शहर का प्रमुख रेलवे स्टेशन है, जो दक्षिण पश्चिम रेलवे ज़ोन के मैसूर मंडल के अंतर्गत आता है। यह स्टेशन पहले बैंगलोर से सिंगल मीटर गेज लाइन से जुड़ा था, जिसे बाद में विद्युतीकृत डबल ब्रॉड-गेज लाइन में बदल दिया गया। यहाँ से बैंगलोर के लिए सबसे व्यस्त रेल सेवा चलती है, साथ ही शताब्दी एक्सप्रेस इसे चेन्नई से जोड़ती है, और चामराजनगर तथा हसन (अर्सिकेरे) के लिए भी शाखा लाइनें हैं। यात्रियों के लिए यहाँ छह प्लेटफॉर्म, प्रतीक्षालय, स्नानघर, क्लॉक रूम और इंटरनेट जैसी आधुनिक सुविधाएँ उपलब्ध हैं। स्टेशन के पास स्थित रेलवे संग्रहालय, जिसकी स्थापना 1979 में हुई थी, दिल्ली के बाद भारत का दूसरा ऐसा संग्रहालय है। इस संग्रहालय में 1899 में मैसूर शाही परिवार के लिए बना 'महारानी सैलून कैरिज' और 1925 की ऑस्टिन रेल मोटर कार जैसे ऐतिहासिक इंजन और कोच प्रदर्शित हैं।