Jonathan (Yoni) Netanyahu (New York, 13 maart 1946 – Entebbe, 4 juli 1976) was een Israëlische commando en de oudere broer van de latere premier Benjamin Netanyahu. Hij diende in de elite-eenheid Sayeret Matkal en werd onderscheiden tijdens de Jom Kipoeroorlog van 1973.

Zijn bekendheid dankt hij aan Operatie Entebbe (juli 1976), een geslaagde Israëlische reddingsactie voor gijzelaars die op 27 juni waren gekaapt en naar Oeganda waren gebracht. Als commandant ter plaatse en mede-planner werd Yoni doodgeschoten door Oegandese soldaten, waarmee hij de enige Israëlische militair was die tijdens de actie om het leven kwam. Ter ere van hem kreeg de operatie officieel de naam Mivtsa Jonathan ('Actie Jonathan'). Op 4 juli 2016 bezocht premier Benjamin Netanyahu Entebbe om de 40ste verjaardag van de bevrijdingsactie te herdenken, wat tevens het startpunt vormde van zijn rondreis door Oost-Afrika.