Club Deportivo Independiente Juniors é um clube de futebol equatoriano criado em 13 de julho de 2017 sob o nome Club Deportivo Alianza Cotopaxi, funcionando como clube filial do poderoso Independiente del Valle (IDV) para projetar talentos da base ao profissionalismo. Em 2018, o time dominou o campeonato provincial de Cotopaxi, conquistou seu primeiro título profissional e garantiu o acesso à Série B, contando com a espinha dorsal dos vice-campeões da Libertadores Sub-20. Após o acesso, foi renomeado para Independiente Juniors em 2019 e, no ano seguinte, transferiu sua sede de Latacunga para Sangolquí (Pichincha), devido a desentendimentos com a associação local. Essa mudança consolidou sua identidade como braço do IDV, mantendo-se como plataforma crucial para jovens jogadores em ascensão. Hoje, o clube é um dos pilares do moderno modelo de formação de atletas do futebol equatoriano, com uma história marcada pela rápida ascensão nos campeonatos locais.