فصل ۰۴–۱۴۰۳ بیست‌وچهارمین حضور استقلال تهران در لیگ برتر ایران بود و آبی‌پوشان در این فصل در سه عرصهٔ لیگ برتر، جام حذفی و لیگ قهرمانان نخبگان آسیا به میدان رفتند. این فصل به دلیل نتایج ضعیف در لیگ و ضعف‌های مدیریتی، به یکی از بدترین فصل‌های تاریخ این باشگاه تبدیل شد و بی‌ثباتی شدید روی نیمکت عامل اصلی این ناکامی‌ها بود؛ چراکه استقلال در ۷ مقطع مختلف، ۶ مربی را روی نیمکت خود دید که شامل جواد نکونام، پیتسو موسیمانه و میودراگ بژوویچ به‌عنوان سرمربیان اصلی و سهراب بختیاری‌زاده، محمد نوازی و مجتبی جباری به‌عنوان مربیان موقت بودند. پس از استعفای نکونام در مهرماه (به‌دنبال شکست برابر السد) و ادامه‌ی ناکامی‌ها با باخت سنگین ۳-۱ به خیبر و ۲-۰ به تراکتور در آبان، اوضاع تیم بیش از پیش وخیم شد. بااین‌حال، استقلال در لیگ قهرمانان آسیا نسبت به سایر تیم‌های ایرانی عملکرد بهتری داشت و سرانجام با قهرمانی در جام حذفی فوتبال ایران توانست این فصل پرحاشیه را با یک جام به پایان برساند. پنجره نقل‌وانتقالات تابستانی این باشگاه نیز از ۷ تیر تا ۲۸ شهریور اعلام شده بود و درمجموع، این فصل به‌عنوان یکی از پرتنش‌ترین اما پایانی‌آورترین دوره‌های تاریخ باشگاه یاد خواهد شد.