รางวัลพิเศษในการประกวดมิสยูนิเวิร์สไทยแลนด์ มีการมอบตั้งแต่ปี พ.ศ. 2543 โดยรางวัลหลักที่จัดต่อเนื่องทุกยุคคือ ขวัญใจช่างภาพ และ มิสป็อปปูล่าโหวต (People’s Choice) การประกวดแบ่งตามยุคผู้จัด ได้แก่ ยุคสุรางค์ เปรมปรีดิ์ (2543–2561), ยุคทีพีเอ็นโกลบอล (2562–2567) และยุคมิสแกรนด์ อินเตอร์เนชั่นแนล (2568–ปัจจุบัน) นอกเหนือจากรางวัลหลัก ยังมีรางวัลพิเศษที่หลากหลาย เช่น Miss Smile by เมืองไทยประกันชีวิต (เริ่ม 2557), Miss Elegance by น้ำดื่มสิงห์ (เริ่ม 2559), Boutique Lady by Bangkok Airways (เริ่ม 2560), ชุดว่ายน้ำยอดเยี่ยม และ Miss Best Skin by Eighteen (เริ่ม 2561) รวมถึงรางวัลเชิงวัฒนธรรมอย่าง งามอย่างไทย (2543–2554) และ ชุดไทยประยุกต์สร้างสรรค์ (2556–2559) นอกจากนี้ยังมีรางวัล ขวัญใจประจำจังหวัด ซึ่งจัดเฉพาะปีที่เก็บตัวต่างจังหวัด เช่น 2548, 2550, 2552 และ 2558 เป็นต้นไป รางวัลเหล่านี้สะท้อนถึงความหลากหลายในการส่งเสริมบุคลิกภาพ ความงาม และวัฒนธรรมไทยของผู้เข้าประกวด