Az elnök-püspök a Magyarországi Evangélikus Egyház lelkészi vezetője, akit a zsinat választ a hivatalban lévő püspökök közül, és aki 2001-ig a püspök-elnök nevet viselte. A tisztséget jelenleg (2024 novembere óta) Szemerei János tölti be, de korábban olyan jelentős személyiségek viselték, mint Káldy Zoltán, Gáncs Péter vagy Fabiny Tamás. Fő feladatai közé tartozik a hivatalos kapcsolattartás más keresztyén egyházakkal és a magyar állammal, valamint az országos presbitérium üléseinek összehívása és az egyház hivatalos lapjának felügyelete. Az országos felügyelővel együtt alkotja az országos elnökséget, és sürgős döntést igénylő helyzetekben az országos presbitérium keretei között önállóan is dönthet. Ugyanakkor hatalma nem terjed ki a többi püspökre és egyházkerületeikre, így szerepe elsősorban a képviseletre és a koordinációra összpontosul, amelyet az egyházi szervezeti törvény (2005. évi IV. törvény) is rögzít.