İstanbul Metrosu'nun M5 (Üsküdar – Sultanbeyli) hattı üzerinde yer alan Çekmeköy Metro İstasyonu, 21 Ekim 2018'de hizmete açılmış olup Çekmeköy'ün Mehmet Akif Mahallesi'nde konumlanır. Aç-kapa yöntemiyle inşa edilen istasyon, 2 girişi, 12 yürüyen merdiveni ve 6 asansörüyle donatılmıştır; ancak 1 numaralı girişi engelli erişimine uygun değildir. İstasyonda İSPARK tarafından işletilen 125 araç kapasiteli bir kapalı "Park Et-Devam Et" otoparkı bulunur ve buraya istasyon içinden asansörlerle erişim sağlanır. Mart 2023'te turnike diziliminde yapılan değişiklik, yolcu sirkülasyonundaki sıkışıklığı önemli ölçüde gidermiştir. M5 hattındaki gece metrosu uygulamasında, Cumartesi ve Pazar günleri 00.00-06.00 saatleri arasında 30 dakikada bir sefer yapılmakta ve bu hizmet çift bilet ücretiyle sunulmaktadır. Çevresinde Şilek Yolu, Madenler Meydanı, Şehit Ahmet Kalafat Doğa Parkı ve Çekirmece Nüfus Müdürlüğü gibi önemli yerler yer alan istasyon, bölgesindeki ulaşım yükünü belirgin şekilde hafifletmektedir.