فصل ۰۵–۱۴۰۴ بیست و پنجمین فصل حضور استقلال در لیگ برتر است و این تیم در رقابت‌های لیگ برتر، جام حذفی، سوپرجام و لیگ قهرمانان آسیا ۲ شرکت کرد، اما این فصل به دلیل جنگ آمریکا و اسرائیل با ایران ناتمام ماند. پس از ماه‌ها بلاتکلیفی و اعتراض هواداران، باشگاه سرانجام با ریکاردو ساپینتو قراردادی یک‌ساله بست و او با رویکرد جوان‌گرایی، نقل و انتقالات را هدایت کرد و بازیکنانی مانند اسماعیل قلی‌زاده را جذب و قرارداد رامین رضاییان را تمدید نمود. از سوی دیگر، رستم آشورماتوف از روبین کازان با قراردادی دو ساله به آبی‌پوشان پیوست و روزبه چشمی نیز یک فصل دیگر تمدید شد. یک نکته داغ در این فصل، مناقشه بر سر دروازه‌بان بود؛ هواداران درباره سید حسین حسینی اختلاف داشتند و باشگاه با جذب حبیب فرعباسی و مذاکره با گزینه‌های خارجی، به دنبال ایجاد رقابت در این پست بود. تیم در ۲۲ تیر ۱۴۰۴ با ترکیبی ناقص به اردوی تمرینی ازمیت ترکیه اعزام شد که اعتراضات دیگری را برانگیخت. به دلیل شرایط جنگی و ناپایدار، ادامه مسابقات بلاتکلیف باقی ماند و آینده باشگاه استقلال همچنان در هاله‌ای از ابهام است.